¿Es obligatorio el uso de certificado electrónico?

Efectivamente. 

De acuerdo al Artículo 10 de la  Ley 39/2015, de 1 de octubre, del Procedimiento Administrativo Común de las Administraciones Públicas. El certificado electrónico cualificado será necesario para el acceso a los buzones, al ser un medio que permite acreditar la autenticidad de la expresión de la voluntad y consentimiento, así como la identidad. 

Por ello, los certificados electrónicos serán necesarios para poder realizar la vigilancia y monitorización de los buzones electrónicos.